Entre bastidores, la Alianza Sufosec está dirigida por el Comité Director. Por regla general, está formado por los directores generales de las seis organizaciones de la Alianza. En la actualidad, el Comité está copresidido por Flurina Derungs (Vétérinaires Sans Frontières Suisse) y Markus Brun (Fastenaktion).